ZESPÓŁ PRACOWNI BADAWCZO-WDROŻENIOWYCH (ZBW)

PRACOWNIA ANALIZY DNA (ZBA)

Tel. 075 7131048 wew. 108 - Kierownik
Tel. 075 7131048 wew. 127 - Pracownia

Pracownicy
----------------------------------------------------------------------
mgr Anna Pasławska
mgr Ewa Kaczmarek
mgr Małgorzata Pałucka - kierownik Zespołu

Realizowane zadania
----------------------------------------------------------------------

 I.     Wykorzystanie chloroplastowych sekwencji mikrosatelitarnych DNA do badań genetycznych nasion sosny zwyczajnej Pinus sylvestris, zdeponowanych jako zasoby genowe w LBG Kostrzyca.

Badania polegają na amplifikacji chloroplastowych sekwencji mikrosatelitarnych w DNA izolowanym z tkanki megagametofitu pięciu losowo wybranych nasion z każdego badanego zasobu oraz z igieł pozyskanych przez pracowników LBG podczas wyjazdów terenowych.

•       Izolacja DNA metodą Doyle and Doyle (1986)

•       Reakcje multipleks PCR z wykorzystaniem 9 sekwencji mikrosatelitarnych w chloroplastowym DNA (Dzialuk i Burczyk 2004)

•       Analiza długości fragmentów DNA z wykorzystaniem analizatora genetycznego (AppliedBiosystems)

Dotychczas przeanalizowano zasoby genowe zebrane z drzew matecznych Pinus sylvestris, pochodzące z następujących Regionalnych Dyrekcji LP:

1.      RDLP w Katowicach,
2.      RDLP w Wrocławiu,
3.      RDLP w Łodzi,
4.      RDLP w Krośnie,
5.      RDLP w Krakowie,
6.     RDLP w Warszawie,
7.     RDLP w Pile,
8.     RDLP w Radomiu,
9.     RDLP w Lublinie,
10.   RDLP w Zielonej Górze

W 2011 roku zaplanowano zbiór igieł z drzew matecznych P.sylvestris na terenie następujących Regionalnych Dyrekcji LP:

1.     RDLP w Gdańsku,
2.     RDLP w Olsztynie.
 

Projekt został rozpoczęty oraz jest realizowany z pomocą merytoryczną Pracowników naukowych Katedry Genetyki Instytutu Biologii Eksperymentalnej Uniwersytetu Kazimierza Wielkiego w Bydgoszczy.

Próbki DNA z każdego drzewa matecznego P.sylvestris są przechowywane w niskich temperaturach, tworząc bazę informacji genetycznych o wszystkich tego typu obiektach nasiennych na terenie Lasów Państwowych. Baza ta będzie systematycznie uzupełniana.

 II.     „Wybór genotypów i populacji cisa pospolitego do ochrony zmienności genetycznej (Badania wspomagające program restytucji cisa w Polsce)”.

Autorem projektu jest prof. dr hab. Andrzej Lewandowski z Instytutu Dendrologii Polskiej Akademii Nauk w Kórniku.

Celem projektu jest zbadanie poziomu zmienności genetycznej w obrębie każdej z wytypowanych 36 populacji cisa pospolitego Taxus baccata w Polsce, a następnie pomiędzy tymi populacjami. Pozwoli to na oszacowanie zróżnicowania genetycznego T.baccata w na terenie kraju, a co za tym idzie na poprawne gospodarowanie nasionami cisa w programie restytucji tego gatunku w Polsce.

Wyniki ww. projektu badawczego będą miały bardzo duże znaczenie dla praktyki leśnej, bowiem określony zostanie zakres przenoszenia materiału rozmnożeniowego cisa pospolitego, możliwe będzie wykluczenie z programu restytucji cisa populacji o niskim poziomie zmienności genetycznej, a także wykluczenie populacji w skład których wchodzą osobniki pochodzenia obcego oraz mieszańcowego (T.cuspidata i T.x media).

Pracownia Analizy DNA współuczestniczy w projekcie od 2009 r. Zgodnie z harmonogramem projektu, Pracownia w bieżącym roku realizuje zadania związane z przygotowaniem zebranego materiału do analiz molekularnych.

 III.     „Wykorzystanie sekwencji mikrosatelitarnych w jądrowym DNA drzew leśnych do udowodnienia pochodzenia materiału dowodowego w postępowaniu sądowym”.

Autorem projektu jest dr Artur Dzialuk z Katedry Genetyki Uniwersytetu Kazimierza Wielkiego w Bydgoszczy.

Lasy Państwowe corocznie ujawniają ok. 10 tys. przypadków kradzieży drewna.

Największa ich część powstaje w wyniku kradzieży drewna z pnia lub z gotowego zapasu, notuje się również przypadki nielegalnego wyrębu drzew.

Celem projektu jest opracowanie i wdrożenie min. do praktyki leśnej (ale również do wykorzystania przez policję, prokuraturę) metodyki zabezpieczania materiału dowodowego na potrzeby analizy DNA, opracowanie metod izolacji DNA z drewna, zbadanie polimorfizmu markerów DNA u wybranych gatunków drzew leśnych, wybór zestawu markerów umożliwiających jednoznaczną identyfikację poszczególnych drzew oraz opracowanie metodyki analiz statystycznych umożliwiających wykorzystanie wyników analiz w postępowaniu sądowym jako dowód w sprawie.

Pracownia Analizy DNA współuczestniczy w projekcie od 2009 r. Zgodnie z harmonogramem projektu, Pracownia w bieżącym roku realizuje zadania związane z monitoringiem zbioru materiału do badań, przygotowaniem oraz przeprowadzeniem izolacji DNA, archiwizowaniem materiału na potrzeby analiz w kolejnych latach trwania projektu.

Opieka naukowo-merytoryczna
---------------------------------------------------------------------------------------------------------------

Tematyka oraz realizacja zadań Pracowni Analizy DNA jest konsultowana z członkami Rady Naukowej LBG Kostrzyca.

W związku z prowadzonymi badaniami oraz wdrażaniem ich wyników do praktyki leśnej, opiekę merytoryczno-naukową oraz pomoc w realizacji zadań w poszczególnych tematach badawczych sprawują min.:

Prof. dr hab. Andrzej Lewandowski- Instytut Dendrologii Polskiej Akademii Nauk w Kórniku,

Prof. dr hab. Jarosław Burczyk- Katedra Genetyki Instytutu Biologii Eksperymentalnej Uniwersytetu Kazimierza Wielkiego w Bydgoszczy,

Dr Artur Dzialuk- Katedra Genetyki Instytutu Biologii Eksperymentalnej Uniwersytetu Kazimierza Wielkiego w Bydgoszczy.

Wyposażenie Pracowni
--------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 
4-kapilarny analizator genetyczny,
Zamrażarka do -80°C
Waga analityczna,
Minikomora laminarna do PCR,
Zestaw do elektroforezy,
Transiluminator z kamerą cyfrową do analizowania wyników elektroforezy,
Dygestorium,
Termobloki,
Termocyklery,
Komputery i oprogramowanie do analizy fragmentów DNA,
Wirówki z chłodzeniem,
System oczyszczania wody,
Drobny sprzęt laboratoryjny.

 Opracowanie: Małgorzata Pałucka